交通运输专业考研的院校选择较多，以下是一些顶尖和优秀的院校：
顶尖院校
东南大学：东南大学在交通运输工程领域具有较高的学术水平和研究实力，被评为A+院校，考研难度也相对较高，但学校提供了丰富的实习和就业机会。
西南交通大学：西南交通大学在交通运输领域享有很高的声誉，尤其在铁路、城市轨道交通方面有着深厚的底蕴和学术水平，被评为A+院校，考研难度也位居前列。
北京交通大学：北京交通大学以铁路交通见长，其交通运输专业也被评为A+等级，具有较高的声誉和实力。在软科2024年专业榜单中，北京交通大学的交通运输专业评分位列全国第一。
同济大学：同济大学在交通运输工程方向的研究领先，尤其是在城市轨道交通方面有着显著的优势，被评为A+或A等级（不同排名略有差异），考研难度也相对较高。
优秀院校
长安大学：长安大学在公路交通领域的教学和研究都非常出色，是交通运输工程领域的重要高校之一，被评为A等级。
大连海事大学：大连海事大学在海运方面有着悠久的历史和雄厚的教学研究力量，是交通运输工程领域的重要学府之一，被评为A等级。
中南大学、 武汉理工大学、 南京航空航天大学、 哈尔滨工业大学、 吉林大学：这些院校在交通运输工程领域也有一定的研究基础和实力，为考生提供了良好的学习和科研环境，均被评为A等级。
其他推荐院校
北京航空航天大学：作为一所综合性大学，北京航空航天大学的交通运输工程专业也具有较高的学术水平和研究实力，被评为A等级。
重庆交通大学、 长沙理工大学、 上海海事大学、 南京农业大学、 中国矿业大学、 浙江师范大学、 昆明理工大学、 华南理工大学、 深圳技术大学、 广州航海学院、 广东海洋大学、 广东工业大学、 广东技术师范大学、 广东理工学院、 北京理工大学珠海学院、 广西科技大学鹿山学院、 广西科技大学南宁学院、 青海民族大学、 宁夏理工学院、 黑龙江八一农垦大学、 哈尔滨华德学院、 北华大学、 白城师范学院、 吉林农业大学、 沈阳航空航天大学、 沈阳农业大学、 辽宁工业大学、 大连交通大学、 辽宁石油化工大学、 沈阳理工大学、 沈阳大学、 大连科技学院、 沈阳城市建设学院、 西藏大学、 新疆农业大学、 昌吉学院、 内蒙古大学、 鄂尔多斯应用技术学院、 内蒙古农业大学、 内蒙古工业大学、 海南大学、 海口经济学院、 福建工程学院、 集美大学、 集美大学诚毅学院、 甘肃兰州交通大学：这些院校也在交通运输专业方面有一定的教学和研究实力，可以根据自身能力进行选择。
建议考生根据自身兴趣、学术背景和职业规划，综合考虑各院校的学科优势、师资力量、研究实力和就业前景，选择最适合自己的院校进行报考。