报考研究生时，可以选择的机关单位主要包括以下几类：
军事院校：
全国共有31个军事单位招收硕士博士研究生，这些单位既为军队培养专业人才，也为地方输送人才。
科研院所：
全国共有193所科研院所，这些机构通常招收的研究生人数不多，但也是研究生招生的重要组成部分。
普通高等学校：
包括综合大学、理工科大学、师范院校、财经院校、政法院校、艺术院校等，这些单位有权自主开展研究生招生工作。
专业研究机构：
如中国科学院、中国社会科学院等国家级科研机构，以及各省市的地方级科研机构。
其他机关单位：
如事业单位、公务员系统、国企、央企等，这些单位通常认可同等学力申硕在职研究生，因为这是国家政策所规定的。
报考研究生时，建议根据自己的兴趣、专业背景以及职业规划，选择合适的招生单位进行报考。