通信工程专业的毕业生在考研时，可以选择以下专业：
通信与信息系统：
该专业是信息与通信工程学科下的二级学科，主要研究信息传输、信息交换等，研究方向包括光纤宽带通信、网络探测和网络管理、移动通信、卫星通信、宽带/高速无线通信、网络与信息安全、专用无线通信系统、电子商务、通信抗干扰系统、电子对抗系统、卫星遥感系统、指挥自动化系统、信息编码与信号传输、语音与图像处理及多媒体通信技术等。
信号与信息处理：
该专业也是信息与通信工程学科下的二级学科，主要研究信号与信息的处理，包括信息获取、变换、存储、传输、交换、应用等环节，应用领域广泛，包括通信、电子、计算机等多个学科。
电子与通信工程：
此专业为专业硕士，主要面向经济社会产业部门专业需求，培养具有特定职业的专业人才，涉及电路与系统、信号与信息处理、无线通信等方面的研究。
电子科学与技术：
该专业主要研究电子器件的设计与制造、半导体技术、光电子技术等。
模式识别与智能系统：
本专业以信息处理与模式识别的理论技术为核心，研究对各种媒体信息进行处理、分类和理解的方法，并构造具有某些智能特性的系统。
电路与系统：
该学科研究电路与系统的理论、分析、测试、设计和物理实现，是信息与通信工程和电子科学与技术之间的桥梁。
通信安全：
随着网络安全的重要性日益增加，通信安全也成为通信工程专业的一个重要研究方向。
人工智能：
部分学校开设的通信相关方向，属于085400电子信息下的具体专业，如人工智能。
建议学生在选择考研专业时，结合自己的兴趣和职业规划，仔细了解各个专业的研究方向、就业前景及录取难度，选择最适合自己的方向。