自动化考研可以选择的大学包括：
1. 清华大学
2. 哈尔滨工业大学
3. 浙江大学
4. 北京航空航天大学
5. 北京理工大学
6. 东北大学
7. 上海交通大学
8. 中国人民解放军国防科技大学
9. 东南大学
10. 西安交通大学
11. 西北工业大学
12. 华中科技大学
13. 山东大学
14. 南京航空航天大学
15. 北京科技大学
16. 哈尔滨工程大学
17. 广东工业大学
18. 中南大学
19. 天津大学
20. 大连理工大学
21. 江南大学
22. 南京理工大学
23. 武汉理工大学
24. 华东理工大学
25. 北京工业大学
26. 北京交通大学
27. 杭州电子科技大学
28. 浙江工业大学
29. 重庆大学
30. 吉林大学
31. 燕山大学
32. 同济大学
33. 湖南大学
34. 华南理工大学
这些大学在自动化专业方面都有较高的教学水平和研究实力，是考研的不错选择。建议根据个人兴趣、学术目标和地理位置等因素，综合考虑这些学校进行选择。