生物工程考研的参考书目通常包括以下几本核心书籍：
生物化学
《生物化学》（上、下册） 王镜岩主编，高等教育出版社
分子生物学
《分子生物学》（第4版） Alexander Mclennan等编著，刘文颖等译校，科学出版社
微生物学
《微生物学》 沈萍，高等教育出版社
细胞生物学
《细胞生物学》 翟中和、王喜忠等，高等教育出版社（第三版）
化工原理
《化工原理》（新版） 姚玉英主编，天津大学出版社
高等数学
《高等数学》（第七版，上、下册） 同济大学应用数学系编，高等教育出版社
此外，考生还应该关注目标院校的研究生招生目录和相关通知，以获取最新的参考书目信息。