药学考研笔记的整理方法如下：
利用记忆树
记忆树是一种关联性记忆法，通过将知识点以树状图的形式进行整理，可以帮助你清晰地梳理出知识点的脉络。以一个主题作为主干，将与其相关联的资料以辐射状呈现，形成树状图。这种方法有助于将复杂的知识点理清楚，并在大脑中形成大致的脉络。
使用不同色号的笔
记笔记时，建议使用不同颜色的荧光笔标注重要的公式或句子，以及彩色的水性笔记录一些重点内容。这样可以利用视觉感知帮助记忆，同时使笔记在翻阅时更加方便和有趣。但应注意避免全篇使用荧光笔，以免失去区分重点的作用。
力求条理清晰
记笔记要有层次和条理，可以使用大标题和小标题来区分不同的层次。大标题和小标题的序号要有明显的区别，以便于后期复习时能够清晰地分辨内容层次。
留出空白
笔记不应过于紧密，要留出一定的空白。在空白处可以根据自己对某一章节的理解做一个小总结，这样既有助于整理思路，又可以在后期复习时快速回顾和总结。
通过以上方法，可以有效地整理出清晰、有条理的药学考研笔记，有助于提高复习效率和效果。