生态工程考研的好学校有以下几所：
中国农业大学：
中国农业大学在环境生态工程专业方面有着很高的声誉，是考研的热门选择之一。
南京农业大学：
南京农业大学也是环境生态工程专业考研的优选学校之一。
西南大学：
西南大学在环境生态工程专业方面也有很好的表现，是考研的不错选择。
四川农业大学：
四川农业大学在环境生态工程专业方面也有一定的优势。
西北农林科技大学：
西北农林科技大学作为985高校，在生态学方面有着较高的录取标准和学术实力。
清华大学：
清华大学的环境科学与工程专业全国高水平，注重环境工程技术的培养。
浙江大学：
浙江大学的环境工程专业在全国范围内排名较高，涵盖多个方面。
北京大学：
北京大学的环境与生态工程专业在教学和研究方面均有很高水平，多学科交叉为其特色。
同济大学：
同济大学的环境科学与工程专业注重多方面的培养，全面发展学生的综合素质。
北京师范大学：
北京师范大学在环境生态工程专业方面排名较高，具有很高的学术声誉。
这些学校在环境生态工程专业方面都有各自的优势和特色，建议根据个人兴趣、研究方向和地理位置等因素进行综合考虑，选择最适合自己的学校。