考研有黑幕的处理方式主要包括以下几种：
取消考试成绩：
根据情节轻重，作弊考生可能会被取消考试成绩，同时可能面临停考一至三年或延迟毕业时间一至三年的处罚，停考期间考试成绩无效。
法律处罚：
组织作弊、提供作弊器材、非法出售或提供试题答案、代考替考等四类行为将触犯刑法，最高可判处七年有期徒刑。
职业禁止：
对于情节严重的作弊考生，除了上述处罚外，还可能面临职业禁止的处罚，即禁止其在一定期限内从事相关职业。
诚信档案记录：
考研被记违规会被计入考生诚信档案，并通报其所在学校或单位，考生名单上报教育部备案。情节严重的，暂停参加各种国家教育考试1到3年。
学校处分：
对在校生，作弊行为将由其所在学校按有关规定给予处分，直至开除学籍。
建议考生增强法制观念，远离考试作弊，以诚信态度参加考试，以免面临严重的后果。