化工制药考研的科目主要包括 思想政治理论、考研英语二、考研数学二以及专业课。专业课方面，不同院校有不同的设置，可能包括化工原理、生物化学、制药工艺学等。
具体到制药工程的不同方向，如药剂学、药物分析、药物化学、药理学、天然药化、生药学、药事管理等，考研科目会有所不同。例如，药剂学的考研初试科目可能包括思想政治理论、英语一、日语、药学基础综合等。
此外，有些院校在专业课的设置上可能还包括物理化学、化学反应工程、有机化学、分析化学、药物化学、药剂学、生物化学、分子生物学、细胞生物学、药理学、临床药学等课程。
因此，建议考生在准备考研时，仔细查看目标院校的招生简章和专业目录，了解具体考试科目和要求，以便有针对性地进行复习。