南京理工大学考研的热门专业和优势专业包括：
兵器科学与技术：
在全国学科实力排名中名列前茅，是南京理工大学的王牌专业，考试难度和热度都很高。
化学工程与技术：
同样是南京理工大学的优势学科，考研难度较大。
机械工程：
考研排名前五的专业之一，适合机械专业的考生报考。
光学工程：
考研排名前五的专业之一。
控制科学与工程：
考研热门报考专业之一。
计算机科学与技术：
从2021年的复试分数线和录取情况来看，是热门报考专业。
电气工程：
考研热门报考专业之一。
管理科学与工程：
考研热门报考专业之一。
英语语言文学 、 外国语言学及应用语言学、 国际商务、 马克思主义理论：
这些专业也是南理工的热门报考专业。
特种能源技术与工程：
化工学院的好专业，属于老牌军工专业。
材料工程、 体育、 公共管理：
这些专业也较为不错。
武器系统与运用工程、 兵器发射理论与技术、 火炮、自动武器与弹药工程：
这些专业在兵器科学与技术学院中招生，录取人数较多，分数也较为可观。
建议
选择专业时，建议结合自己的兴趣和职业规划，同时考虑专业的就业前景和学科实力。
由于热门专业竞争激烈，建议提前了解复试分数线和录取情况，做好充分的准备。
对于新兴交叉学科，如生物医学工程、生物技术与工程等，虽然招生人数有所提升，但可能竞争相对较小，可以作为一个选择方向。