微生物考研可以报考的专业主要有以下几种：
资源与应用微生物学：
研究微生物的资源开发和应用，包括微生物在农业、工业、医学等领域的应用。
病源微生物学：
研究病原微生物的生物学特性、致病机制和防治方法。
微生物发酵与代谢工程：
研究微生物发酵过程及其代谢产物的开发利用。
生物防治微生物学：
研究利用微生物进行生物防治的方法和技术。
环境微生物学：
研究微生物在环境中的生理、生态作用和污染物的生物降解等。
真菌学：
研究真菌的生物学特性、分类、生态和应用。
微生物学：
研究微生物的生理学、生态学、分类学和应用等方面的学科。
分子生物学：
研究微生物的分子结构和遗传机制。
生物化学：
研究微生物的化学组成、代谢过程和生物合成等。
生物技术：
利用微生物进行生物技术和工程应用。
建议根据个人兴趣和研究方向选择具体的专业。例如，对微生物资源开发和应用感兴趣的学生可以选择资源与应用微生物学；对病原微生物和生物防治感兴趣的学生可以选择病源微生物学和生物防治微生物学。同时，还可以考虑学校的学科优势和师资力量，选择最适合自己的学校和专业。