南航和南理工都是江苏省内知名的211工程大学，且都是国家双一流大学，在全国大学排名中位于前列。关于哪个学校考研难度更大，以下是一些参考信息：
专业差异
南理工在计算机学院下的模式与识别专业较为强势，竞争可能相对较大。
南航在航空航天领域有显著优势，相关专业研究生培养水平较高。
竞争程度
考研难度与报考人数、招生名额等因素有关。
两校都有各自的优势专业，竞争程度可能因专业而异。
个人情况
考生自身的背景、兴趣和备考情况也会影响考研难度。
本校生通常在考研中具有一定优势。
总体评价
两校考研难度都较高，属于211中的第一档次，但具体难度还需结合个人情况和具体年份评估。
综上所述，南航和南理工的考研难度不能一概而论，考生应根据自己的专业兴趣、学术背景以及备考情况做出选择。建议考生关注目标专业的报录比、招生名额等信息，并结合实际情况做出决策。