基础医学考研的高校包括以下几所：
北京大学
综合实力国内领先，基础医学教育处于国内领先水平，尤其在临床前药理学、人类遗传学、微生物学等方面居于国内领导地位。
北京协和医学院
中国医学科学院基础医学研究所和北京协和医学院基础学院成立于1978年，拥有15个学系和一个对国内外开放的医学分子生物学国家重点实验。
复旦大学
基础医学研究生专业教学质量高，已成为全国性的研究生培养中心，尤其在病理学、胚胎学与生殖学、医学免疫学等方面拥有强大的师资力量和教学资源。
上海交通大学
基础医学专业作为国家特色学科一直处于国内领先水平，注重培养学生的创新意识和实践能力，拥有系统完备的自主研发药物、检测设备等研发平台。
中山大学
教育部和广东省共建的全国重点大学，国家“985工程”、“211工程”重点建设高校，同时也是“珠峰计划”、“111计划”、“卓越医生教育培养计划”实施高校。
南京医科大学
基础医学专业排名前十，具有较全面的综合素质和较强的创新精神。
华中科技大学同济医学院
顶尖医学院校之一，拥有较高的教学水平和科研实力。
北京航空航天大学
基础医学考研数据表明其录取难度较高。
中国药科大学
基础医学考研数据表明其录取难度较高。
浙江大学
基础医学考研数据表明其录取难度较高。
这些高校在基础医学领域具有很高的教学水平和研究实力，是考研学子的优选之一。建议根据个人兴趣、研究方向和职业规划，综合考虑各高校的学科优势、师资力量和科研条件，选择最适合自己的高校进行报考。