在考研选择细菌微生物专业时，可以考虑以下几所学校：
北京大学：
在微生物学专业方面具有很高的声誉，评估结果为A+，是考研的理想选择。
清华大学：
同样在微生物学专业方面表现优异，评估结果为A+，也是顶尖的选择。
上海交通大学：
在微生物学领域也有很高的排名，评估结果为A+，适合考研。
武汉大学：
在微生物学方面有着一流的水平，评估结果为A+，是考研的热门选择。
江南大学：
在微生物学领域具有较深的积累，研究方面具有优势，评估结果为A，考研难度适中。
南京农业大学：
是微生物学考研的学校之一，位列三强之一，评估结果为A，相对容易考入。
云南大学：
在微生物学领域具有很高的声誉和实力，评估结果为A-，适合考研。
山东大学：
在微生物学方面也有一定的研究实力，评估结果为A-，考研难度适中。
中国科学技术大学：
在微生物学专业方面具有很高的研究实力，评估结果为A，考研难度较大。
中国农业大学：
在微生物学专业方面具有很高的声誉，评估结果为A，考研难度适中。
这些学校在微生物学领域都有较高的研究水平和学术声誉，选择哪一所学校取决于个人的兴趣、研究方向以及考研的竞争力。建议根据自己的实际情况和目标，仔细考虑每所学校的优势和难度，做出最合适的选择。