生物医学工程考研选择学校时，可以考虑以下几所知名院校：
北京大学：
生物信息学领域具有显著地位，生物工程专业国内领先。
复旦大学：
生物医学工程专业全国排名前列，学科实力强，学术环境良好。
浙江大学：
生物工程专业在国内享有高声誉，综合性强。
上海交通大学：
985工程、211工程院校，生物医学工程领域表现突出。
清华大学：
生物物理学及结构生物学专业名列前茅。
华中科技大学：
理工科大学，生物工程专业在国内有很高知名度。
中山大学：
985、211高校，生物学专业全国排名靠前。
北京协和医学院：
生物医学工程领域有独特优势，A+评级。
东南大学：
在生物医学工程领域有丰富教学资源和科研实力。
四川大学：
生物医学工程方面教学资源丰富，科研实力雄厚。
西安交通大学：
生物医学工程专业在医学电子与信息处理方向表现出色。
选择学校时，建议根据个人兴趣、研究方向、以及学校的教学资源和科研实力进行综合考虑，并关注最新的学科评估结果和学校排名信息。同时，建议多了解院校情况，制定合理的复习计划，并做好备选方案。