在厦门，提供研究生教育的大学包括：
厦门大学：
中国著名的“985工程”和“211工程”重点建设的高水平大学之一，具有优秀的研究生导师和丰富的研究资源。
集美大学：
福建省重点建设高校，交通运输部与福建省共建高校，国家“卓越工程师教育培养计划”试点高校。
华侨大学（厦门校区）：
华侨大学在厦门设有校区，提供研究生教育。
厦门理工学院：
是一所新兴的本科高校，近年来也开始招收研究生。
福建师范大学：
福建省重要的教学科研基地，也设有研究生教育。
厦门海洋学院：
提供研究生教育。
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