考研三门式的学校包括：
1. 清华大学，其软件学院考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
④914 软件工程基础综合（包括数据结构、操作系统、软件工程）
2. 北京航空航天大学，计算机学院和软件工程学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
④961 计算机专业基础综合（包括计算机组成原理、操作系统、计算机网络技术）
3. 哈尔滨工业大学，计算机科学与技术学院、国家示范性软件学院、威海、深圳校区的考研科目为：
①101 政治
②201 英语一
③301 数学一
④837 网络与信息安全基础（包括计算机网络、信息安全、网络安全）
4. 上海交通大学，电子信息与电气工程学院和软件学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
5. 北京邮电大学，软件学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
④807 软件工程专业综合（包括数据结构、操作系统、数据库系统原理，其中操作系统和数据库系统原理二选一）
6. 华东理工大学，信息科学与工程学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
④815 计算机专业基础综合（包括数据结构、计算机组成原理、操作系统）
7. 南京理工大学，计算机科学与工程学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
④877 计算机专业基础C（包括计算机组成原理、数据结构、操作系统）
8. 中国海洋大学，计算机学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
9. 北京大学，软件与微电子学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
④839 数据结构、计算机网络、操作系统
10. 复旦大学，软件学院的考研科目为：
①101 思想政治理论
②201 英语一
③301 数学一
这些学校都要求考研时考三门科目，具体科目设置请参考各学校的官方招生目录。