在舟山考研的大学主要是 浙江海洋大学。浙江海洋大学是自然资源部与浙江省人民政府共建的高校，也是浙江省重点建设高校之一。学校创建于1958年，始名舟山水产学院，1975年更名为浙江水产学院，1998年与舟山师范专科学校合并组建为浙江海洋学院，2000年之后舟山卫生学校、浙江水产学校、浙江省海洋水产研究所、舟山石油化工学校和舟山商业学校等学校（单位）相继并入，2016年更为现名。
此外，虽然浙江大学海洋学院位于舟山市的新城区定海境内，但它主要侧重于海洋科学类相关学科，包括海洋工程、海洋技术等专业，并且与浙江海洋大学不同，它是一所全日制普通本科高等院校。
因此，对于想在舟山考研的学生来说，浙江海洋大学是一个重要的选择。