南京大学和南京医科大学都是医学领域的知名高校，各有其独特的优势和特点。具体哪个更好，取决于个人的学习目标和职业规划。以下是它们之间的一些比较：
专业实力
南京医科大学：在医学专业方面，南京医科大学在多个医学领域都有很高的声誉，特别是在临床医学、口腔医学、公共卫生等领域。学校的师资力量雄厚，实习医院资源丰富，能够为学生提供良好的实践机会。
南京大学：南京大学医学院在科研方面实力强劲，拥有丰富的研究资源和优秀的教授团队。学校注重培养学生的科研能力，提供了众多的实验机会和科研项目。对于希望从事科研工作的学生来说，南京大学医学院是一个理想的选择。
考研难度
南京医科大学：由于其在医学领域的专业实力，南京医科大学的考研难度相对较高，但具体难度因人而异。
南京大学：南京大学作为985高校，虽然整体考研难度较大，但其医学院的招生人数较多，相对容易考一些。
就业前景
南京医科大学：南京医科大学在江苏省内的认可度极高，毕业生在各大医院就业有优势，特别是在南京地区的医院。
南京大学：南京大学作为国内顶尖高校，其毕业生在就业市场上具有很高的竞争力，无论在全国范围内还是南京本地，都有很好的就业机会。
个人兴趣和发展方向
南京医科大学：如果你希望成为一名临床医生，注重临床技能和实战经验的培养，南京医科大学可能更适合你。
南京大学：如果你对科研感兴趣，希望从事医学研究，南京大学医学院可能更适合你。
建议
如果你更看重临床实践和就业前景，并且希望留在江苏省内发展，南京医科大学可能是更好的选择。
如果你希望从事科研工作，或者希望借助南京大学的平台进一步提升自己，南京大学医学院可能更适合你。
最终的选择还是要根据你的个人兴趣、职业规划以及家庭背景等因素综合考虑。建议你可以先了解两所学校的具体招生情况、专业设置和实习医院等信息，再做决定。