选择考研院校时，建议综合考虑学校的 学科实力、地理位置、学校声誉以及个人职业规划等因素。以下是针对郑大和南京工业大学的详细比较：
学科实力
郑州大学：
郑州大学是211工程、双一流高校，整体实力较强，尤其在医学、材料科学与工程等领域表现突出。
土木工程排名和结构排名全国靠前。
南京工业大学：
南京工业大学虽然不是211工程大学，但在土木工程、材料科学与工程、化学工程与技术等学科方面具有较强的实力。
光学工程是国家一级重点学科，实力较强。
地理位置
郑州大学：位于河南省郑州市，是河南省最好的学校之一，地理位置优越，有利于在河南及其周边地区发展。
南京工业大学：位于江苏省南京市，虽然地理位置较为南方，但城市基础设施完善，且南京正在大兴土木，就业机会较多。
学校声誉
郑州大学：作为211和双一流高校，学校声誉较高，无论是师资力量、综合办学实力还是社会影响力都较强。
南京工业大学：虽然学校整体声誉不如郑州大学，但在某些专业领域如化工、土木工程等方面具有较高的声誉。
个人职业规划
郑州大学：适合希望在河南及其周边地区发展，或希望进入医学、材料科学与工程等强势学科的学生。
南京工业大学：适合希望在南方发展，特别是南京及其周边城市，或对土木工程、材料科学与工程等专业感兴趣的学生。
建议
如果注重学校整体实力和地理位置，且希望在河南及其周边地区发展，郑州大学是更好的选择。
如果注重专业实力和南方城市的就业机会，且对土木工程、材料科学与工程等专业感兴趣，南京工业大学也是一个不错的选择。
最终选择还需根据个人兴趣、职业规划和实际情况进行综合考虑。