考研成绩出现负分的原因主要有以下几种：
运输过程中试卷丢失：
在试卷从考点运输至评卷点的过程中，有可能发生丢失的情况。如果考生未收到试卷，则无法进行评分，从而出现负分。
缺考：
如果考生并未参加某门科目的考试，考官则无法给出该科目的分数。根据相关规定，缺考科目的成绩会被记为负分，通常为-1分。
成绩登记失误：
虽然这种情况较少见，但理论上如果成绩登记过程中出现错误，也可能导致考生成绩出现负分。然而，这种情况相对较为罕见。
综上所述，考研成绩出现负分的主要原因是运输过程中试卷丢失或考生缺考。建议考生在考试前仔细检查相关准备，确保所有材料齐全，并按时参加考试，以避免因缺考等原因造成成绩损失。