在日本留学的学生可以选择报考以下大学：
东京大学：
作为日本顶尖的世界一流大学，东京大学在理科和工科方面具有极高的国际地位，物理和化学学科世界排名第一，工学也位于世界前列。
京都大学：
亚洲排名第2，世界排名前三十，是一所超一流大学，各个专业领域均表现出色，尤其在理科方面有着很高的声誉。
东北大学：
亚洲排名第三，世界排名第54，以医学、工学和理学闻名于世，鲁迅和苏步青等著名学者均毕业于该校。
大阪大学：
日本国立研究型综合大学，全国排名第三，位于大阪府，医学院和工学院在国际上享有高评价。
东京工业大学：
专注于工程技术与自然科学研究，是日本顶尖的理工类大学，科技方面走在前沿。
御茶水女子大学：
位于东京都文京区，是顶尖的女子大学，有“女子东大”之称。
广岛大学：
国内211大学，相当于日本的地方国公立大学，学科设置广泛，整体排名进入前百。
冈山大学：
同样是211大学，位于冈山县，学科设置全面，学术氛围浓厚。
千叶大学：
位于千叶县，是一所综合性大学，学科实力强，研究设施先进。
北海道大学：
位于北海道，是一所历史悠久、学术实力雄厚的综合性大学，尤其在理科和农学方面表现突出。
建议学生根据自身的专业兴趣、学术背景及未来职业规划，选择合适的大学进行报考。同时，提前准备好日语能力和相关考试，如EJU考试和校内考，以提高录取成功率。