日本留学签证过期通常是因为未能及时申请延长或变更在留资格。根据日本入国管理局的规定，如果你没有在签证到期前至少2个月开始申请在留期间的延长或变更手续，即使你并非有意逾期逗留，也会被视为“非法逗留者”。
为了避免这种情况，你应该注意以下事项：
提前申请：
在留期间的延长可以在到期前至少2个月开始申请，所以应该尽早办理申请手续。
准备续签材料：
续签日本留学签证通常需要以下材料：
出席证明书
成绩证明书
身元保证书（由保证人填写）
保证人在职证明书
保证人所得证明书
陈述书（自己填写，可在事务室领取陈述书用纸）
请确保在签证到期前完成所有必要的续签手续，以避免不必要的麻烦。