处理日本留学生案子的方法如下：
在日本犯罪
如果行为在日本，首先需要按照日本的法律规定进行立案侦查和处罚。
如果行为严重到涉及刑事案件，可能会面临罚款、有期徒刑等刑事处罚，以及学校层面的处分，如取消奖学金、停学、遣返等。
回国后的处理
根据《中华人民共和国刑法》第七条和第十条的规定，如果行为在日本已经受到刑事处罚，且最高刑期不超过三年以下有期徒刑，可以不予追究。
如果行为在日本已经立案侦查，即使回国后，也可以依照中国法律追究其刑事责任，但在日本已经受到的处罚可以免除或减轻处罚。
具体案例说明
例如，有中国留学生在日本打架并导致对方受伤，情节严重的情况下，可能会被拘留并面临刑事指控。即使双方都是外国人，日本警方仍会受理此类案件，并按照刑事案件处理。
另一案例中，一名中国留学生因严重犯罪被日本判处死刑，最终被执行，这表明对于严重犯罪的留学生，日本法律会予以严厉惩处。
建议
遵守法律：留学生在日本应严格遵守当地法律，避免触犯法律。
及时沟通：一旦出现问题，应尽快与学校和相关机构沟通，寻求帮助和解决方案。
咨询专业律师：在处理复杂法律问题时，建议咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。
以上信息仅供参考，具体处理方式还需根据案件的具体情况和当地法律进行判断。