留学日本回国的流程主要包括以下几个步骤：
确认在留卡有效期
检查在留卡的有效期限，确保在回国前更新，避免逾期留在日本。
购买机票
根据在留卡有效期和学校放假时间，选择合适的回国日期。
提前至少3个月购买机票以获取更优惠的价格。
选择直达航班或行李直挂的中转航班，避免额外托运。
报备计划
向学校事务所报备回国计划，可能需要填写特定申请表格。
打包行李
提前整理行李，注意不要超重，并确保所有重要文件齐全。
出发前检查
确认护照、在留卡等重要证件齐全。
核酸检测
遵循中国驻日领事馆官网指定的检测机构进行核酸测试，并获取双阴性证明。
防疫健康码
使用微信搜索“防疫健康码国际”，申报检测结果，等待审核通过。
机场准备
提前至少3小时到达机场，进行安检和登机。
入境政策
携带护照、机票、在留卡、核酸证明以及防疫健康码（绿码）。
抵达国内机场后，进行落地核酸检测、随身行李过安检、海关入境审核，并乘坐交通工具前往隔离酒店进行隔离。
其他手续
清理宿舍，结清所有费用，包括房租、水电费和燃气费。
办理市役所转出登记，如果有加入国民健康保险，需解约。
注销银行账户，尤其是信用卡，并解约手机卡，避免产生欠费或不良信用记录。
请根据最新的政策和实际情况调整以上步骤。