日本留学预科的选择，可以考虑以下几个因素：
学校声誉和合作院校
北京语言大学：国内提供日本留学服务最早的大学之一，与日本多所知名大学有合作关系，升学率高达80%。
北京第二外国语学院：同样是国内较早开办日本留学预科的学校，与日本前30名校有精英班、艺术/动漫班等多种班型。
北京外国语大学：合作院校包括东京大学、京都大学、大阪大学等日本顶尖大学，提供多种日语课程和留学服务。
电子科技大学：合作院校广泛，包括东京工业大学、一桥大学等，学费相对较低。
课程设置和教学方法
北京语言大学：分班教学，提供针对性录取和教学，有TOP30精英班、免留考直升班、艺术/动漫班等。
北京第二外国语学院：提供日本早稻田大学留学定向班、日本前30名校精英班、艺术/动漫班等，注重日语能力考试、留考、日本文化等方面的培训。
北京外国语大学：与日本三所比较好的日本语学院合作，学生可以选择在北外读一年或半年日语课程，达到申请条件后由学校帮忙递交申请。
电子科技大学：注重日语基础教学，同时提供留考专项辅导。
学费
北京语言大学：学费范围在3.58~5.98万元之间。
北京第二外国语学院：学费标准在4.6万元/半年至6.6万元/年之间。
北京外国语大学：一年制学费6.2万元（含留考），半年制学费4万元。
电子科技大学：学费为4.6万元/半年。
服务和支持
北京语言大学：提供日本留学一条龙服务，包括接机、协助租房、办卡等。
北京第二外国语学院：提供全程的留学申请和毕业就业指导服务。
北京外国语大学：有专业的留学顾问和教师团队，提供全面的留学支持。
建议
根据目标院校和专业选择：如果希望进入日本顶尖大学，如东京大学、京都大学等，北京外国语大学和北京第二外国语学院是很好的选择。如果对艺术或动漫专业感兴趣，可以选择北京语言大学的艺术/动漫班。
考虑个人情况和需求：选择预科班时，应考虑自己的日语水平、学习能力和经济状况。例如，如果日语基础较弱，可以选择提供预备课程的机构。
了解升学率和就业情况：选择预科班时，可以查看学校的升学率和就业情况，选择教学成果显著、就业支持有力的学校。
综合考虑以上因素，北京语言大学、北京第二外国语学院和北京外国语大学都是优秀的日本留学预科选择。建议根据自己的具体情况和需求，选择最适合自己的预科班。