公派留学项目取消的原因主要有以下几点：
优化资源配置：
国家公派硕士研究生项目包括赴国外攻读硕士学位研究生和联合培养硕士生，但每年派出人数较少，仅800名，在所有国家公派留学项目中占比不高。因此，有推测认为取消硕士项目是为了将资源集中应用于资助博士或更高学术阶段的留学生，以帮助他们取得更高的科研成就。
硕士项目性质：
在西方发达国家教育体系中，硕士项目一般为过渡性质，许多立志于从事科学研究的学生会选择本科毕业后博硕连读或直接攻读博士项目。因此，取消公派硕士研究生的初衷可能是为了优化资源配置，将资源集中在更有学术价值的领域。
成本效益分析：
公派硕士项目的取消可能还基于成本效益分析，认为硕士项目回国服务的利益比不上资助出国的成本。而联合培养博士的人数增加，意味着申请联合培养博士的成功率将会提高，这可能是更有效的资源利用方式。
自费留学增加：
近年来，自费留学人数不断增加，公派留学相较自费留学仍属少数。有观点认为，取消公派硕士项目可以鼓励更多学生选择自费留学，从而减轻国家财政负担。
综上所述，公派留学项目的取消主要是为了优化资源配置，将资源集中应用于资助博士或更高学术阶段的留学生，以提高科研成就和资源利用效率。同时，这也可能是应对自费留学增加的一种策略。