日本留学生喜欢的大学主要有以下几所：
东京大学：
作为日本第一学府和学术之巅，东京大学在科研、文科、理工科等领域都堪称顶尖。其丰富的英文授课项目，特别是研究生课程，以及坐落在东京中心的优越地理位置和强大的校友资源，使得它成为留学生们的首选。
京都大学：
以“自由学风”闻名，京都大学是第二古老的大学之一，研究生院尤其出色，特别适合想专注科研的同学。校园环境优美，被京都的历史文化包围，生活成本相对较低，非常适合留学生生活。
早稻田大学：
早稻田大学是日本最知名的私立大学之一，也是留学生最多的大学之一。文科、商科、社会科学等学科在亚洲都有极高声誉。学校国际化氛围浓厚，提供丰富的英文授课项目，校内社团活动丰富，让留学生活更加多彩。
东北大学：
东北大学是继东京帝国大学、京都帝国大学之后的第三所旧制帝国大学，以医学、理工科闻名。学校强调研究第一，毕业生多成为研究人员和大学教员。
大阪大学：
位于日本大阪府的世界级著名研究型国立综合大学，在科学研究等领域有着极高的国际声誉。大阪大学在工学、医学等领域有着显著成就，研究氛围严谨而开放。
庆应义塾大学：
庆应义塾大学是日本历史悠久的综合私立大学，以文科和理工科实力均衡著称。生物、政治等专业水平极高，学校还是日本超级国际化大学计划A类顶尖校之一。
东京工业大学：
东京工业大学在工程技术、材料科学等领域有着世界领先的研究水平，特别受理工科学生青睐。
这些大学各有特色，留学生可以根据自己的兴趣、学术目标和生活方式选择最适合自己的学校。建议在选择大学时，综合考虑学校的学术声誉、专业特色、地理位置、生活成本以及留学生支持服务等因素。