日本留学保证金存款的步骤和注意事项如下：
了解要求
确定所需保证金的金额，通常为20万元人民币。
了解存款的存期和货币种类。
准备资金
将资金存入定期存单，存期通常为3-6个月。
存款应存放在经费支付人名下。
选择银行
推荐选择中国四大银行（工商银行、农业银行、中国银行、建设银行）进行存款，以获得更高的认可度和简化的手续。
存款证明
向银行申请开具存款证明，证明在指定日期有特定金额的资金冻结。
存款证明通常需要包括存单和存折的复印件。
资金证明
如果资金是通过工资形式分批存入，需要提供相关的银行转账记录。
如果选择贷款作为资金来源，需要提供贷款的完整证明。
提交材料
在申请签证时，将存款证明作为重要的经济证明文件提交给签证官。
注意事项
尽量在签证申请前3-6个月完成存款，并冻结资金。
存款证明的有效期应覆盖整个签证申请过程。
保留好所有相关的银行单据，以备不时之需。
请根据以上步骤和注意事项准备留学保证金，并确保所有文件齐全、真实有效。