清朝留学儿童回国的主要原因可以归纳为以下几点：
文化冲突
留学生在美国接受西方教育，受到自由民主思想的影响，对封建礼教产生质疑，剪去辫子、穿着洋装，与女孩子约会等行为在当时的封建社会被认为是不合适的。
政府政策
清政府对于留学生有严格的考核制度，成绩不合格者会被遣送回国。
清政府希望留学生学成后回国报效国家，但面对留学生个性和思想的转变，政府感到失望，决定提前召回。
个人选择
一些留学生在美国适应良好，不愿放弃在美国的生活和学业，选择留在美国继续深造。
部分留学生因身体原因无法承受长途跋涉或在美国水土不服，病逝于异国他乡。
留学生在美国接受西方科技文化教育，意识到国家的落后，希望通过学习西方科学技术来挽救祖国。
以上因素综合作用，导致部分清朝留学儿童选择回国，而另一部分则选择留在美国继续他们的学业和发展