日本留学时，以下理科专业是非常值得推荐的：
计算机科学
日本在软件开发领域具有较高水平，计算机产业在国际上享有盛誉。IT专业包括通讯技术、C语言、信号与系统等计算机相关课程和高等数学等理科基础课程。日本的IT行业非常火爆，教育质量世界一流，就业前景广阔。
电子电气工程
日本的电子电气技术一流，电子电气学科发展历史悠久，是日本传统的优势学科。研究领域涵盖了拓扑绝缘体、量子计算、量子点激光器、碳纳米管等世界前沿研究。
机械工程
日本的机械制造业处于全球领先水平，机械工程专业的教育质量高，就业前景好。涵盖机械设计、制造、自动化、能源与动力、材料等多个领域。
环境科学
日本非常注重环境治理，大学开设了很多环境相关的专业。环境科学主要研究环境的地理、物理、化学、生物等方面，进行环境保护、监测、质量评价、规划管理等。
生物科学
日本在生物科学方面的研究处于世界前列，生物学专业被称作生命科学专业，受到日本政府的高度重视和扶持。应用领域广泛，包括农业、工业、医学、能源、环境和化工等。
化学工程
化学工程是日本留学申请中的热门专业，在QS世界大学学科排名中，日本的化学工程专业排名位于世界前列。
土木工程
日本是一个地震多发的国家，土木工程专业的耐震设计闻名全球。研究领域包括结构、材料、岩土、地基，以及水利工程和防灾等方向。
情报工学
情报工学是一门偏理工科的学科，研究信息的产生、传递并利用规律和现代化手段使情报系统保持最佳效能。内容涵盖电脑硬件与软件的研究、电脑应用技术以及系统工程学等。
这些专业不仅学术水平高，而且就业前景广阔，特别适合希望在日本学习并留在日本工作的学生。建议根据个人兴趣和职业规划，选择最合适的专业进行深入学习。