南京到日本留学的费用对比可以从以下几个方面进行：
语言学校或别科
学费：65万-80万日元/年，平均相当于人民币4万-5万元。
国立大学
入学金：28万日元（部分特定生14万日元），相当于人民币1.5万元。
每年学费：56万日元，相当于人民币3万元多，各系基本相同。
学部4年总费用：第一年学费4.5万元 + 3万元×3年 = 13.5万元。
私立大学
入学金：20万-35万日元（部分学生减免），相当于人民币1.2万-2万元。
文科每年学费：70-90万日元，相当于人民币4万-6万元。
理科或艺术类每年学费：90-150万日元，相当于人民币6万-9万元。
医学部每年学费：300万-3000万日元，相当于人民币18万-180万元。
学部4年总费用：文科第一年6万元 + 4.5万元×3年 = 19.5万元；理科第一年10万元 + 7.5万元×3年 = 32.5万元。
大学院
基本费用与学部相同，但略少一些。
私立大学2年总费用：第一年学费5万元 + 4万元 = 9万元；第二年学费4万元，总计13万元。
国立大学2年总费用：第一年学费4.5万元 + 3万元 = 7.5万元。
建议
选择学校：根据个人学术背景、经济条件及专业选择，国公立大学学费较低但竞争激烈，私立大学学费较高但可以提供更多的专业选择和生活支持。
奖学金：留学生可以通过考出高分获得奖学金，减少实际支付费用。
生活费用：生活费因城市和个人消费习惯不同而有所差异，东京等大城市生活费用较高，其他城市相对较低。
这些数据可以帮助你更全面地了解南京到日本留学的费用情况，从而做出更为明智的选择。