非法在日本留学的后果可能包括：
罚款：
轻微违法行为可能会被处以几千到几万日元的罚款。
刑事处罚：
严重违法行为可能会面临高额罚款或有期徒刑。例如，随地吐痰可能会被罚款1,000至10,000日元，而打架斗殴可能会被判处6个月以上有期徒刑。
学校处分：
留学生如果违反学校规定，可能会受到如取消奖学金、停学一年、甚至遣返等处分。
法律后果：
如果行为在日本已经立案侦查，将依照日本法律处理。如果返回中国，根据《刑法》第七条属人管辖原则，可能会适用中国《刑法》，但最高刑为三年以下有期徒刑的，可以不予追究。
出入境证件问题：
根据《中华人民共和国出境入境管理法》，非法滞留日本的中国公民可能会被收缴出境入境证件，并且在一定时间内（6至36个月）不予签发出境入境证件。
其他后果：
包括被学校开除、取消留学签证，甚至可能面临逮捕和判刑。
请注意，以上信息基于过往的数据和法律，具体处罚会根据案件具体情况而定。