学校保留学籍的原因主要有以下几点：
获得教育财政拨款：
学籍是学校获得学生人头费的依据。每个高中生每年能给学校带来1.2万-1.3万的教育财政拨款。学校通过保留学籍，可以确保在学生未到校的情况下仍获得这部分拨款。
应对上级检查：
学校为了应对上级不定时的检查，需要制造学校“教得好”“学生乐意留在学校”的假象。通过超长羁押学生，保证“出勤率”，从而保住学籍，避免被注销。
休学、转学或其他原因：
学生可能因个人原因（如身体原因、家庭原因等）需要暂停学习，但又不打算放弃学籍，此时可以向学校提出休学或转学申请，同时保留学籍。保留学籍的时间上限通常由各校自行规定，超过规定时间未能重新回到学校的学生可能会被取消学籍。
参军、留学等特殊情况：
如果学生因参军服役或出国留学需要离校，学校可以给予保留学籍的机会，通常保留期限最长不超过两个学年。
学风教育未达到留级标准：
对于正在进行学风教育但未达到留级标准的学生，学校可以给予保留学籍的机会，保留期限最长不超过一学年。
病患或其他特殊情况下需长期休学：
如果学生因病或其他特殊原因需要长期休学，学校可以保留学籍，保留期限最长不超过两个学年。
其他特殊原因：
对于因非上述情况离校的学生，也可以申请保留学籍，但需要经过学校的审核和批准。
综上所述，学校保留学籍主要是为了确保教育财政拨款的获得、应对上级检查、满足学生的休学、转学需求，以及特殊情况下的学籍保留。这些措施有助于学校的管理和运营，同时也为学生提供了更多的选择和灵活性。