日本留学办理护照需要准备以下材料：
近期免冠照片一张以及填写完整的《中国公民因私出国（境）申请表》。照片要求为2寸近期正面免冠彩色照片，背景色以各地出入境管理处规定为准。
居民身份证和户口簿的原件及复印件。在居民身份证领取、换领、补领期间，可以提交临时居民身份证和户口簿及复印件。
未满十六周岁的公民，应当由其监护人陪同，并提交其监护人出具的同意出境的意见、监护人的居民身份证或者户口簿、护照及复印件。
部队院校在读无军籍学员还须提交所在院校出具的无军籍证明，军人携带军官证（或者离退休证）、部队《因私事出国（境）人员审查批件》原件，所在部队须在《中国公民因私出国申请审批表》上出具意见并盖章，负责人要亲笔签名确认。
登记备案的国家工作人员申办因私护照必须由单位在《中国公民因私出国申请审批表》上出具意见，负责人签名并加盖公章。
在留资格认定证明书原件及复印件。
户口本复印件（首页及申请人页）。
留学调查表。
暂住证或居住证明（限户籍非本馆管辖范围者）。
毕业证明书或毕业证书复印件。
学费支付者的在职证明。
接受学校出具的入学通知书。
经济保证证明。
自费留学资格审核证明（限具有大专以上学历的人员）。
宗教课程学习同意证明（限出国学习宗教课程的人员）。
公派留学人员相关证明（限公派留学人员）。
语言能力证明（必须掌握基本的日语）。
留学生代理人的资格证明。
留学生的简历。
留学生的最高学历证书。
个人照片2张。
留学理由书。
个人履历书。
誓约书。
日本入境签证申请表。
申请人与保证人关系的证明。
保证人的纳税证明书。
建议提前咨询当地公安机关出入境管理机构，了解具体的申请费用和流程，以确保材料齐全且符合要求。