上海留学落户的难点主要包括以下几个方面：
档案问题
无学籍档案或工作档案：部分初中毕业后就出国学习的学生，在回国落户时发现没有相关档案，需要先回原籍人才中心补建档案。
社保基数不足
社保基数未达到要求：留学生落户上海需要满足一定的社保基数要求，目前1倍社保基数为11396元，7月份调整后预计为12000元左右。社保基数不足将无法申请落户。
违法问题
有犯罪记录：留学生在申请落户时需要证明没有犯罪记录，否则将被视为不符合条件，无法办理落户手续。
未婚配偶问题
未婚配偶需合法结婚：如果留学生有未婚配偶，需要提供相关材料证明其具有合法结婚资格并经过婚姻登记程序。
户口类别问题
农业户口：虽然农业户口已被取消，但如果户口本上仍显示为“农业家庭户口”，在申请落户时可能会遇到困难。
学历学位问题
学位缺失：如果留学生只获得毕业文凭而没有学位证书，将无法享受留学生落户政策。
学历认证问题：学历学位认证书是必须材料，如果毕业院校无法进行学历认证，则不能申请落户。
转学分问题：境外获得的学分必须满足一定比例，否则可能影响落户资格。
学习时间问题
学习时间不足：留学生必须在回国后的2年内来沪工作并累计社保，否则可能失去落户资格。
社保个税问题
社保缴纳记录：留学期间有职工社保个税记录可能会对落户申请造成负面影响。
社保基数和个税不一致：社保、个税、劳动合同三者不一致也会影响落户申请。
公司问题
公司不符合要求：公司需在上海市注册且注册资金达到一定标准，同时需要提供相关授权书。
公司被列入黑名单：如果公司被列入黑名单，留学生将无法通过该公司申请落户。
个人问题
个人违法违规记录：如有酒驾、计划生育、刑事犯罪等记录，将无法申请落户。
建议留学生在申请落户上海前，仔细检查自身条件和材料，确保符合政策要求，避免因这些问题影响落户进程。