申请日本博士留学主要有以下几种途径：
申请大学院研究生（博士预科）
适合人群：适合没有日语基础或日语水平较低的学生，先入学跟随教授做研究，强化专业知识学习，之后再参加博士入学考试。
申请条件：一般只有国公立大学院才有大学院研究生制度，需要确认目标院校是否有此制度。
申请流程：先申请研究生，在读期间准备博士入学考试，考试合格后入读博士课程。
申请语言学校
适合人群：适合日语基础较差的学生，在日本学习日语的同时备考博士入学考试。
申请条件：无特定学历要求，但需具备基本的日语能力。
申请流程：申请语言学校，学习日语，同时准备博士入学考试。
直接赴日参加博士入学考试
适合人群：适合语言能力和专业能力都很强的学生。
申请条件：需要具备较高的日语和专业能力，能够办理旅游签证赴日参加考试。
申请流程：备考心仪院校的博士入学考试，考试合格后入读博士课程。
申请SGU项目（全英文授课项目）
适合人群：适合英语优秀、硬件条件不错的学生。
申请条件：需要具备良好的英语能力（如托福或雅思成绩），本科和研究生阶段成绩优异。
申请流程：直接在中国申请日本的博士课程，无需参加笔试，只需参加资料审查和网络面试。
其他注意事项：
学历要求：一般申请者需要具备硕士学位或被认定具有同等学力，医学、牙科及兽医学的本科课程学制为六年，毕业后可直接报考博士课程，但必须具备18年以上的学历。
语言能力：良好的日语能力是申请日本博士的必备条件，一般要求日语水平至少达到N2，部分商科专业要求更高。
研究计划书：日本大学对研究计划书的要求较高，需要详细描述研究目标、方法、创新性和学术价值。
联系教授：在申请过程中，联系教授是必不可少的环节，提前与教授沟通，获得其认可可以增加申请成功率。
财力证明：申请日本留学需要提供财力证明，以确保有足够的经济支持完成学业。
根据以上信息，学生可以根据自身情况选择最适合自己的申请途径。建议提前规划，准备好所有必要的材料，并在申请过程中与目标院校的教授保持良好沟通，以提高申请成功率。