日本留学中介费用通常包括以下几个部分：
申请院校费用：
包括学费定金和申请费，具体金额因学校和专业而异。
文书费：
中介在文书准备过程中收取的费用。
签证指导费用：
指导学生办理签证的费用。
其他费用：
可能包括体检费、公证费、保险费、培训费等。
中介费用一般在1万元人民币左右，但具体费用可能因中介机构和申请项目的不同而有所差异。此外，留学日本的总费用可能包括中介服务费、境外服务费、学费、住宿费和生活费等，最高费用可能达到4万元人民币左右。
选择留学中介时，建议仔细比较不同机构的服务内容和费用构成，并警惕可能的隐形费用。同时，明确合同中的服务内容和费用，确保透明和公正