日本留学回国需要准备以下证件：
护照
护照原件及复印件。
学位证书和毕业证书
学位证和毕业证的原件及复印件。
对于在日本取得论文博士学位者，需提供研究证明、学位申请书等相关材料。
成绩单
学习成绩单原件和复印件，建议提供日文和英文版。
出入境记录
护照上的出国记录复印件。
留学回国人员证明
可在日本国内的中国大使馆教育处办理。
公证认证
学历和学位证明通常需要办理公证认证，以适用于国内就业、升学等。
其他可能需要的文件
如遇特殊情况，留学回国人员证明可作为学历认证的辅助材料。
对于无犯罪记录证明，通常也需要进行公证认证。
请确保在回国前准备好所有必需的文件，以免影响后续手续的办理。