日本留学生兼职打工需要缴纳的税款取决于收入金额。以下是一些基本的税收规定：
国税：
从打工工资中直接扣除的部分称为所得税的国税，通常由雇主代扣代缴。
对于在日本居住满1年以上的留学生，通常需要缴纳工资总额的10%作为所得税。
对于居住不满1年或一次工资超过100万日元的留学生，可能需要缴纳20%的所得税。
地方税：
所得税总额会被送到居住地的市区町村役所，根据纳税额可能需要缴纳都道府县税或市町村税等地方税。
免税额度：
普通留学生一年收入在100万日元出头可能可以免税，但具体情况可能因个人情况和年度收入变化而异。
税收申报：
在每年的2月中旬至3月中旬之间，留学生需要申报全年的总收入扣除必要开支后的收入金额，以确定最终应缴纳的税额。
特殊情况：
如果留学生在日本排名较好的大学或大学院就读，并且签证类型为“留学”，可能可以免除部分税金。此外，留学生在毕业回国时也可以向税务署申请退还在留学期间打工所交纳的税金。
请注意，以上信息可能随时间和政策变化而有所不同，建议咨询专业的税务顾问或直接联系日本税务署获取最新信息