日本留学签证申请被拒签可能由以下原因造成：
经费支付问题
提供的资产证明不足以支付学习及生活费用。
未能充分证明有持续稳定支付费用的能力。
经费支付者的收入证明与申请人的留学计划不匹配。
材料问题
提交的材料存在虚假或不真实，如毕业证、成绩单造假。
材料准备不全或细节处理不当。
语言能力
申请者的日语能力未达到入国管理局的基本要求。
在留经历
申请人有不良的在留历史，如被遣返或强制驱逐。
隐瞒或未申报过去的入国经历。
学习动机与能力
未能充分证明有强烈的学习意愿和能力。
未能提供充分的日语学习经历和日语能力证明。
其他问题
未能合理解释过去的拒签理由。
未能提供与申请相符的详细学习计划或理由书。
如果您的日本留学签证申请被拒绝，建议您详细审查上述可能的原因，并根据具体情况进行针对性的准备和申诉。