日本留学海关检查通常包括以下几个方面：
海关申报单填写
需要如实填写海关申报单，包括是否携带违禁物品、违法光盘以及是否携带超过规定数额的现金等。
物品检查
可能抽查行李，检查是否有违反海关规定的物品，如动物制品、植物制品、假冒伪劣产品、超过限量的医药品和化妆品等。
现金检查
检查是否携带超过规定限额的现金，通常限额为100万日元。
证件检查
出示有效护照、签证、在留资格认定书、入学通知书等重要文件。
检疫手续
办理卫生检疫手续，可能需要出示相关的健康证明。
边防检查
填写出境登记卡，与护照和登机牌一起交给边防警官检查。
安全检查
走过金属探测器门，随身行李需通过X光机检查，禁止携带危险物品。
新《出入境管理及难民认定法》要求
16岁以上的外国公民需接受脸部拍照和指纹采集。
请确保遵守所有规定，以避免在海关遇到不必要的麻烦。