在日本留学申请学费通常遵循以下步骤：
确定留学目标：
明确是申请语言学校、大学本科还是研究生项目。
选择合适中介：
专业中介可简化申请流程。
准备申请材料：
包括学历证明、语言成绩等，不同项目要求不同。
递交申请并参加面试：
语言学校可能安排面试，本科或研究生有笔试，留学中介可提供面试辅导。
办理签证：
准备好相关材料办理留学签证。
抵达日本并完成入学：
按时报到，办理居留卡等手续。
缴纳学费：
通常在拿到录取通知书和签证之后，按照学校官网上公布的账号汇款到日本院校，并保存好缴费凭证。
申请学费减免：
如果需要，可以在入学时填写申请表格，并提供经济情况证明和教授意见书。
请注意，以上步骤可能因学校、项目和个人情况有所不同。建议详细查阅目标学校的具体指南和要求。