在日本，留学休学半年后转学的流程通常包括以下几个步骤：
咨询原学校：
首先需要向当前就读的学校咨询有关休学后转学的政策和流程。
选择目标学校：
在了解原学校的规定后，选择想要转入的目标学校，并收集该学校的转学信息。
准备申请材料：
根据目标学校的招生要求，准备必要的申请材料，如成绩单、语言成绩证明、推荐信等。
提交申请：
将准备好的申请材料提交给目标学校，可以通过学校官网或邮件等方式进行。
等待通知：
提交申请后，需要耐心等待目标学校的审核结果。
请注意，不同学校可能有不同的具体要求和流程，因此在进行转学操作时，务必详细了解并遵守目标学校的具体规定。此外，如果打算在日本高中之间转学，情况可能会更加复杂，因为许多高中并不提倡学生转学，可能要求学生先从原学校办理退学手续，并可能重新办理日本留学手续。