日本留学生申请研究生的费用主要包括以下几个方面：
1. 学费：
国立大学研究生：约75.5万至90万日元/年。
公立大学研究生：约82万至100万日元/年。
私立大学研究生：人文科学约101万至109万日元/年，社会科学约103万至109万日元/年，医、牙学约109万至115万日元/年。
2. 其他费用：
检定料（报名费）：约9800日元。
入学金：约84600日元。
研究料（学费）：约346800至441200日元/年。
3. 生活费：
房租：东京地区约7万至10万日元/月，其他地区略低。
饮食费：约6万至10万日元/月。
水电煤气费：约5000至10000日元/月。
交通费：电车约5000至10000日元/月，出租车可能更贵。
网络费和电话费：约9000至15000日元/月。
日常消耗品：约5000至10000日元/月。
以上费用仅为参考，实际费用可能因学校、专业、课程、地区及个人生活方式等因素而有所不同。建议根据个人情况和目标学校进行详细查询和预算