日本留学过关时需要携带的证件主要包括：
1. 护照：作为身份证明，必须随身携带。
2. 签证：根据申请的签证类型，可能包括留学签证、工作签证等。
3. 在留资格认定书：证明你在日本有合法居留的资格。
4. 入学许可证：如果是首次入境，需要出示以获取在留卡。
5. 印章：在日本，印章在法律事务中有重要作用，通常需要准备全名章和姓氏章。
6. 成绩单和毕业证书：部分学校可能要求提供官方成绩单和学位证明。
7. 眼镜的验光诊断书、牙齿诊断书等健康相关证明（如果适用）。
8. 资格外活动许可：如果打算在日本打工，需要提前申请。
9. 国民健康保险证：证明已加入日本的医疗保险体系。
10. 电话卡：用于日常通讯，部分运营商可能要求提供护照复印件。
请确保所有文件都是最新的，并且符合日本入国管理局的要求。如果有任何疑问，可以在出发前咨询所在学校或使领馆获取最新信息。