根据提供的信息，生物博士在日本留学的费用大致如下：
学费
公立大学博士课程学费大约在每年53.5万至86万日元之间，折合人民币约2.6万至4.2万元。
私立大学博士课程学费通常在每年100万至150万日元之间，折合人民币约5万至7.4万元。
第一学年通常需要缴纳入学金，大约在30万日元左右，折合人民币约2万元。
从第二学年开始，由于无需再缴入学金，每年的学费会比第一年减少约30%。
生活费
膳食费约3万日元，房租约3万日元，水电煤气费约0.7万日元，交通费约0.8万日元，保险医疗费约0.3万日元等，一个月生活费大约在8-9万日元，折合人民币约5000-6000元。
东京等大城市的生活费更高，每月接近15万日元。
其他费用
奖学金机会较多，如日本学术振兴会特别研究员奖学金（JSPS）可提供资金支持，每月约20万日元。
总费用估算
以3年制博士课程为例，公立大学总费用约为7.6万人民币（仅学费），加上入学金、保险等三年共计约189.3万日元，折合人民币约9万元。
私立大学总费用可能更高，具体取决于学校和专业。
请注意，以上费用仅为估算，实际情况可能因个人选择（如专业、学校、地区等）和汇率波动而有所不同。建议在做具体规划时，查询目标学校和专业的最新费用信息，并考虑可能的奖学金和减免机会。