留学日本延毕的后果主要包括以下几点：
无法参加修士考试：
如果学生在夏季出愿时没有毕业证也没有预毕业证明，将无法参加修士考试，只能等待下一次机会，从而影响整个考研的时间安排。
签证更新问题：
虽然有些观点认为延毕不会影响签证的更新，但这可能会带来一些不确定性，因为签证的具体要求和更新流程可能会因学校和情况而异。
学校材料问题：
学校开出的在读证明和成绩单需要显示学生能顺利本科毕业。如果无法按时毕业，可能会影响这些材料的获取，进而影响申请学校的过程。
导师质疑：
如果延期毕业是因为学分不够或毕业论文不合格等学习能力问题，导师可能会对学生的科研水平产生质疑，这可能会影响学生的升学和职业发展。
经济压力：
延期毕业可能会增加学费和生活费用的支出，给学生带来经济压力和负担。
就业延迟：
延期毕业可能会推迟学生进入职场的时间，使他们在就业市场上面临更激烈的竞争和机会减少的风险。
学业压力：
延期毕业可能会给学生增加学业压力，需要更多的时间和精力来完成学业要求和毕业任务。
社会压力：
延期毕业可能会受到社会及家庭的压力和质疑，因为传统观念认为按时毕业是成功的标志之一。
综上所述，留学日本延毕可能会带来一系列的负面影响，包括无法参加重要的考试、签证更新问题、学校材料获取困难、导师质疑、经济压力、就业延迟、学业压力和社会压力等。因此，建议学生在规划留学时间时尽量避免延毕，确保能够按时毕业并获取所需的证明材料。如果确实无法按时毕业，应及时与学校和导师沟通，了解可能的影响和解决方案。