日本留学签证的办理流程和入境通道有关，具体如下：
签证申请
日本大使馆或领事馆：直接申请，需准备护照、照片、在留资格证明、入学通知书等材料。
签证服务中心：通过授权机构申请，方便快捷，可能需要支付服务费。
中介机构：通过中介申请，提供一站式服务，费用可能较高，需选择信誉好的机构。
在线申请：通过日本政府的在线申请系统申请，方便快捷，需要一定的网络技能和英语水平。
入境通道
日本人·永住者通道：适用于日本公民或拥有日本永久居住权的人。
再入国通道：适用于之前离开日本后再次入境的人。
外国人通道：适用于持有日本留学签证的外国人，签证在此通道中作为申请上陆在留资格的凭证。
请注意，签证的作用仅限于在入境时作为在留资格的证明，一旦入境，签证即刻作废。