留学日本时，通常需要准备以下公证文件：
学历证明：
包括毕业证书、学位证书，可能需要进行公证和认证。
亲属关系证明：
需要证明学生与经费支付人（如父母）之间的亲属关系，通常需要公证。
经济担保：
如果由父母或其他亲属提供经济支持，可能需要提供父母的在职证明、收入证明、纳税证明以及银行存款证明等。
出生公证：
证明个人的出生事实，有时用于办理日本居民身份证、银行开户等。
语言学习证明：
如日语能力考级证书等，证明有足够的日语能力适应日本的学习和生活。
其他可能需要的公证：
根据具体情况，可能还需要提供其他一些材料，如签证申请书、在留资格认定证明书等。
请注意，具体所需公证文件可能因学校、专业或申请签证类型的不同而有所差异。建议在准备留学材料之前，详细咨询目标学校或日本入国管理局，了解最新的要求和流程